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药物-靶蛋白结合位点分析

药物-靶蛋白结合位点分析

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产品名称: 药物-靶蛋白结合位点分析

英文名称: HDX-DrugSite

产品编号: ZK102

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更新时间: 2026-02-03T10:53:53

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新一代氢氘交换质谱与分子计算模拟集成药靶互作结构解析系统

本产品通过将氢氘交换质谱(HDX-MS)的实验观测能力与分子模拟的计算阐释能力深度融合,实现了从“定位结合区域”到“解析结合机制”的跨越,为药物发现提供动态、精确的决策依据。

核心在于建立 “实验数据驱动计算,计算结果反馈验证”的闭环工作流。

 

技术路线:

01. HDX生成动态口袋

快速检测药物结合引起的蛋白质构象变化与动态性差异,精确到肽段水平。

02. 数据引导的分子对接

以上述动态口袋为约束条件,指导药物分子对接,确保模拟起点更贴近真实生物状态。

03. 增强分子动力学模拟

在HDX提示的关键变化区域进行强化采样,高效获取高精度结合姿态与动态轨迹。

04. 整合分析与机制提取

交叉比对模拟轨迹的原子相互作用与HDX动力学数据,提取结合关键残基、作用力网络及变构路径。

 

整合互补技术  实现优势倍增

技术模块 核心贡献 整合优势

HDX-MS实验

提供真实的、全局的蛋白质动态变化数据,灵敏度高,无分子尺寸限制。 为模拟提供“地面实况”锚点,大幅缩小计算搜索空间,确保模拟的生物学相关性,克服单纯模拟的起始偏差问题。
分子模拟计算 提供原子分辨率的、时序连续的三维结构动态与能量景观信息。 将HDX信号转化为机制见解,精确指认关键残基、可视化变构信号通路、量化相互作用贡献,克服HDX分辨率不足的限制。

 

送样要求:纯化靶蛋白(≥1mg/ml,≥100ug)。
交付周期:标准服务周期为20个工作日(高级服务延长至30个工作日)。